细胞中基因的表达是严格按照时间和空间顺序发生,因此细胞类型和基因表达具有时间特异性和空间特异性。时间特异性可以通过收集不同时间点的样本进行单细胞转录组测序来分析。但是单细胞转录组测序(scRNA-Seq)在单细胞悬液制备的过程中破坏了细胞的空间结构,无法给出固态异质化组织中细胞空间排布信息。而空间转录组可以解决这个问题,其以点阵形式记录组织切片细胞的空间信息,在保留组织形态结构的基础上,获得细胞/基因的空间表达特异性。单细胞技术从 2009 年发展到现在,研究范围不再局限于转录组,扩展到了基因组、免疫组、蛋白组等多组学水平。高通量测序单细胞多组学技术支持
单细胞测序技术(SingleCellSequencing)从一种新兴的研究角度,借助已有的高通量测序手段,帮助研究者在疾病样本的异质性、样本微环境、发育学、免疫学以及其他领域中进行单细胞层面的数据解析,解决了BulkPopulationSequencing所无法解决的问题。这样一个新的研究领域必然也需要足够可靠的实验手段来支撑。BDRhapsody单细胞分选系统为此提供了完善的硬件设备,保证了从单细胞悬液质量评估到单细胞分选标记过程中每一个实验步骤的完善质控。NovelBio单细胞实验团队借助BDRhapsody单细胞分选系统,在实验实施层面对单细胞测序结果的可靠性提供了强有力的保证。继单细胞悬液制备之后,又在另一道关键关卡提供了可靠的支持,帮助研究者在单细胞测序领域收获更多的成果。无锡BD Rhapsody单细胞多组学单细胞多组学测序技术是在单细胞分辨率下精确分析细胞异质性和基因调控网络的新技术。
基于桥式PCR技术的簇生成可以将模版链迅速扩增成千上万倍,保证过程中足够的测序深度。测序时使用特殊标记的dNTP:1)碱基上通过敏感键修饰上不同的荧光基团,用于区分ATCG;2)3端使用叠氮基团封闭,保证一次循环只上一个dNTP。每一轮循环结束时,会通过高速荧光显微镜记录荧光图像,再通入试剂除去荧光基团和叠氮基团,开启下一循环。通过分析读取同一位点的荧光,实时获取模版链的碱基序列。由于过程中使用的化学反应并不可控,随着循环数的增大会出现不同步的情况,因此Illumina的读长只能限制在200bp左右。
烈冰与国内高校、研究所、医院和药企单位开展深度合作,服务于600+临床与研究机构,1000+客户和5000+重要科研项目,助力并联合发表300+篇CNS等国际学术期刊(不完全统计),在单细胞领域,烈冰助力用户发表单细胞文献30+篇,总IF>300+,IF>10+以上文章占比65%以上,包含Immunity、NatureCellBiology、NaturePlants、AdvancedScience等生物领域国际主流学术期刊,已发表文章研究领域涵盖包括COVID-19研究、疾病发生转移机制,免疫研究、脑神经、白血病、胚胎发育、糖尿病、退行性疾病和植物领域研究等。单细胞多组学测序技术整合了单细胞各个组学特征, 提供了揭示细胞内复杂分子调控网络及其互动关系的机会。
空间转录组测序与单细胞测序的结果不同,这里存在一个概念叫做NumberofSpotsundertissue,即,空间转录组片子上组织覆盖的有效的spot位点。这个有效Spot的筛选标准是有UMI以及有序列表达。那么这个时候,贴片的质量就成为了制约空间转录组有效区域的要点了。如果组织没有很好地覆盖到空转片上,那么容易出现虽然有HE染色有组织片子,但是没有基因表达,即无有效Spot位点。同样的,另一个就是组织切片的大小,也就是说组织切片在整个玻片的覆盖面积越小,分析的有效区域就越少。这两者基本上决定了整个空间转录组分析结果的基础质量。分子检测型单细胞多组学测序技术大多数以转录 组测序为重点。无锡烈冰单细胞多组学数据分析可视化
为了能深入分析和理解细胞状态和命运决定的机制, 将单细胞各组学技术结合在一起的单细胞多组学技术产生。高通量测序单细胞多组学技术支持
对于单细胞测序而言,常常需要先构建细胞图谱,在此基础上再开展后续各项分析,并且数据分析时以细胞聚类(cell cluster)为讨论对象,而不是像常规Bulk测序一样以组别为分析对象,因此单细胞测序项目对样本入组要求没有Bulk测序那样严格,但是单细胞测序,特别是目的为图谱研究时,需要通过提高样本复杂度(增加样本数),尽可能的构建某一疾病类型、群体细胞图谱信息。因此,单细胞测序实验设计时首先需要保证生物学重复,不同样本来源的样本建议单独进行细胞解离和捕获、建库、测序,以保证捕获到足够的细胞数,单个样本分别捕获细胞时,后续分析除了整体分析以外,还可以做单样本分析,保证分析的完备准确性。高通量测序单细胞多组学技术支持
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